در سال 1343، با تاسیس موسسه آموزش عالی دختران واحد تربیت بدنی به صورت تدریجی در این مجموعه ارائه گردید. بعدها این دروس با توسعه و ساخت ساختمان تربیت بدنی و سالن های ورزشی در سال 1347 و استخر شنا در سال 1348 گسترش یافت. دانشکده تربیت بدنی و علوم ورزشی در پی کسب موافقت اصولی و قطعی در سال 1373 تاسیس شده و با ظرفیت 56 نفر در سال 1374 در دو رشته دبیری تربیت بدنی و کارشناسی تربیت بدنی و علوم ورزشی شروع به کار نمود. رشته تربیت بدنی جانبازان و معلولین در مقطع کارشناسی در سال 1376 به تصویب وزارت علوم، تحقیقات و فناوری رسید. دانشکده تربیت بدنی و علوم ورزشی دانشگاه الزهرا(س) تنها دانشکده ای بود که تا سال 1384 این رشته را در جهت توسعه ورزش جانبازان و معلولین ارائه نموده بود. از سال 84 دانشجویان کارشناسی در رشته تربیت بدنی و علوم ورزشی و 3 گرایش رفتار حرکتی، مدیریت ورزشی و فیزیولوژی ورزشی پذیرفته شدند. با توجه به تغییر سرفصل مقطع کارشناسی در سال 93 و 94 دانشجویان در رشته علوم ورزشی با دوگرایش علوم زیستی و علوم انسانی وارد دانشگاه شدند و از سال 95 و تغییر مجدد سرفصل کارشناسی، دانشجویان در رشته کارشناسی علوم ورزشی پذیرفته شدند.